intense conditions of the ship - напряжённая атмосфера, царившая на корабле
chamber sanctuarine - алтарный, святилищный зал/комната
he had been almost ebullient, bombastic - пафос и энергия в нём едва не выплескивались через край :)
The union of once-disparate vessels was as incongruous as the product of their fusion - несуразное нагромождение разномастных кораблей, словно слипшихся/сплавленных вместе