Чьи? Разве что, эльдарские или таусяццкие.
В принципе, какая-нибудь группа солдат, захватив чужой корабль, может им воспользоваться, чтобы добраться к своим. Но включать чужие корабли в состав своего флота - ОЧЕНЬ маловероятно. Непонятно и то, как его смогли захватать, и то, как им смогли управлять.
Кстати, по сюжету - вряд ли в космосе корабли распознают друг друга по внешнему виду - скорее, по опознавательным сигналам, переговорам, видеосвязи и т.д. Так что еще можно представить, что имперцы захватят корабль Эльдар. Маловероятно, что они смогут им управлять. Совершенно невозможно, чтобы другие Эльдар приняли этот корабль за своего.