В таком случае:
1. При стрельбе по Гидре - только инициатива гидры (т.к. в ее случае погонщики просто маркеры и убить их нельзя)
2. При стрельбе по монстру с правилом "монстер и погонщики" будет использоваться инициатива монстра, но дырки потом будут распределяться между монстром и погонщиками (смотри спец правило в книге правил)
3. В случае стегадона точно не скажу, все зависит от наличия правила "Монстер и погонщики" у него. Если оно есть, то как в пункте 2, если его нет, то попадания распределяются еще до пробивания (наверное это расписано в его книге армии), соответственно и инициатива там будет разная для разных моделей.
P.S. А то что "Если цель имеет разные значения инициативы, то надо использовать высшее значение." это написано для кавалерии, например, или для колесницы, где модель одна а профаил разделенный.