Есличо, пример Армагеддона в плане того, что кто-то командует морячками, нерепрезентативен.
Они туда прилетели потому что откликнулись на призыв о помощи. Не были переброшены, как полки ИГ, а сами решили, что поучаствуют в этой заварушке. И ради повышения эффективности участия встроили себя в цепочку командования.
Примеры всяких вармастеров типа Махария, командующих Астартес - тоже не об этом. Морячки сами принимают решение присоединиться к такому-то крестовому походу.
Ну и насчет того, что Астартес воспринимают "благо Империума" не так, как жалкие людишки - так Испивающие Души на этом и погорели.
Наконец, о том, что тысяча орденов мотается по Галактике безконтрольной - так в Империуме формально теократия, а они долбаные Ангелы Императора, большинству людей и в голову не прийти не может, что их как-то можно контролировать. Вон, Вольные торговцы тоже беспризорными шляются где хотят, целые армии собирают и творят что хотят - и никто не возмущается, потому как на это есть патент, выданный самим Импи (или лицами, временно исполняющими его обязанности).