Где-то во флаффе упоминалось, что Дети Императора название не сменили отчасти от того, что боевой клич "Дети Императора - смерть врагам Его!" очень удобен в плане дезинформации.
А еще где-то было про то, что легион остался верен Императору, но через призму слаанешизма - двинувшись головой, решили вырезать все обычное человеческое население, дескать, они не подходят под идеалы папочки, вершина творенья - космодесантник, остальные - черви презренные, чье существование есть оскорбление Императора.