Не совсем понял вопрос, эффект доктрин - это правило доктрин, к ЧТ не имеет никакого отношения.
В случае с конклавом с индепом (я так понимаю, весь конклав и индеп - один отряд), единственная проблема в том, что "If a unit contains models drawn from two different Chapters, it counts as from neither Chapter, and thus benefits from neither Chapter Tactic.", а для заявления доктрины по тактике ультры нужен отряд ультры в армии, а смешанный отряд таким не является. Достаточно иметь одного либра отдельно, чтобы заявлять. Доктрины работают на модели ультры, поэтому на конклав (и только на него) работать точно будут.