В первую очередь, надо укрепить разум. Нет, ну, правда. В Вахе вообще не идет речь о спасении Вселенной, это вы как-то сами вдруг придумали. В Вахе идет борьба за выживание видов, соответственно о спасении только "своих", а все остальные, включая Вселенную, могут гореть, как говорится, синим пламенем.
Ни Империум, ни их СМ никогда не были белыми, пушистыми и, как вы пишете, лояльными. Зная их методы, можно догадаться, что они и своих экстерминируют при надобности, а не то, что парочку ксеносных планет. Также и большинство остальных рас.
Сомнения могут быть в отношении тау, которые, как будто гуманнее, но не факт, что это просто юношеский максимализм, который пройдет, будет Империи Тау столько же лет, сколько и Империуму людей. Да и Фарсайт как бы намекает.
На мой взгляд, именно обреченность и безысходность делают Wh40k тем, чем она являюется, дают ей обаяние и особый шарм, выражающийся в словах "все умрут"